RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 TSPEARQ8WU66 669 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 GAB3Q8WWW8 586 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FATE1Q969F0 183 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 COA7Q96BR5 231 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 MVB12AQ96EY5 273 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SCN4AP35499 1836 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0A6YYJ9 748 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 N4BP3O15049 544 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 NRP2O60462 931 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 MYBP10242 640 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ITGB4P16144 1822 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 NEK3P51956 506 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 IL13RA1P78552 427 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FOXO4P98177 505 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 MLANAQ16655 118 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 CST9Q5W186 159 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 NOX5Q96PH1 765 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ADI1Q9BV57 179 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SGPP1Q9BX95 441 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 KCND1Q9NSA2 647 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 DNM3Q9UQ16 869 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SBF1O95248 1867 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 APAF1O14727 1248 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRM-208ENST00000578600 GPR15P49685 360 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 HUNKP57058 714 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FKBP1BP68106 108 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 NFATC3Q12968 1075 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 MALLQ13021 153 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PGS1Q32NB8 556 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 LONRF3Q496Y0 759 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRM-208ENST00000578600 PHF19Q5T6S3 580 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRM-208ENST00000578600 H3BML4 177 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRM-208ENST00000578600 PMM2O15305 246 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 BBOX1O75936 387 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 CAMTA2O94983 1202 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ZBED1O96006 694 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 RHCEP18577 417 aa6.6□□□□□ -1.35
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