RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 DEPTORQ8TB45 409 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 MTMR9Q96QG7 549 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 MAN2B1O00754 1011 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 ADRB1P08588 477 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 CCR2P41597 374 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 FOSBP53539 338 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 NRLP54845 237 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 WASF1Q92558 559 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 UROC1Q96N76 676 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 ASB16Q96NS5 453 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 TRIP11Q15643 1979 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 ABLIM3O94929 683 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 GDI1P31150 447 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 NAMPTP43490 491 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 PPP2R5DQ14738 602 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 PADI6Q6TGC4 694 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 VITQ6UXI7 678 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 CEP120Q8N960 986 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 POLD4Q9HCU8 107 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC40-206ENST00000572083 F5P12259 2224 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 BTBD18B2RXH4 712 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 SEC24AO95486 1093 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 SATB1Q01826 763 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 ST3GAL2Q16842 350 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 PPM1JQ5JR12 505 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 FAM3CQ92520 227 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 IRF7Q92985 503 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 NACC1Q96RE7 527 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 ATF2P15336 505 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 CCR3P51677 355 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 NETO1Q8TDF5 533 aa21.81■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 NCANO14594 1321 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 PODXLO00592 558 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 ZNF197O14709 1029 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 RETP07949 1114 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 PSMC3P17980 439 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 CYP11B2P19099 503 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 MCM7P33993 719 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 VIPR2P41587 438 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 OSTNP61366 133 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 PPP2R5AQ15172 486 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 SMARCD2Q92925 531 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 IER2Q9BTL4 223 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 SLC30A4O14863 429 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 GJA1P17302 382 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 CCNE1P24864 410 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 DMWDQ09019 674 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 GAS6Q14393 721 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 ELMOD1Q8N336 334 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 NECAB1Q8N987 351 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 USP24Q9UPU5 2620 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 MOSPD3O75425 235 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 MICAL2O94851 1124 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 MYL4P12829 197 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 KCNA4P22459 653 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 EFNA5P52803 228 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 IFT74Q96LB3 600 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 CDT1Q9H211 546 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC40-206ENST00000572083 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms