RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF365Q70YC5 407 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 VSTM4Q8IW00 320 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 BEST2Q8NFU1 509 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 LMO3Q8TAP4 145 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 CXorf38Q8TB03 319 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 TOP1MTQ969P6 601 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-210ENST00000568388 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.21■□□□□ 0.83
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SPNS1-210ENST00000568388 VNN1O95497 513 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SYCP1Q15431 976 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 NAB2Q15742 525 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.2■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 RAB20Q9NX57 234 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 DPP3Q9NY33 737 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SCN1AP35498 2009 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 LAMA3Q16787 3333 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 PHACTR2O75167 634 aa20.19■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 BIRC3Q13489 604 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 HELQQ8TDG4 1101 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 HERVK_113Q902F9 699 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 FAM84AQ96KN4 292 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SIX4Q9UIU6 781 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 FGFR1P11362 822 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SLC9A1P19634 815 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 LRPAP1P30533 357 aa20.18■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 FIGNQ5HY92 759 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.18■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 SEMA4DQ92854 862 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 GCNT4Q9P109 453 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.18■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 DGKIO75912 1065 aa20.17■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 KCNJ6P48051 423 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 RBP5P82980 135 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 TRPC3Q13507 836 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.17■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 POMCP01189 267 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 ITGB3P05106 788 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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SPNS1-210ENST00000568388 TUSC3Q13454 348 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 UROC1Q96N76 676 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 SIX2Q9NPC8 291 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-210ENST00000568388 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.16■□□□□ 0.82
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