RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558804.5

APBA2-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 2, human

TSL 4

Gene APBA2, Length 535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA2-208	ENST00000558804	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.74	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	MYH11	P35749	1972 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804		I3L4J1	428 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CUTA	O60888	179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	KCNE1	P15382	129 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	STAT6	P42226	847 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	BRCC3	P46736	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	GLUD2	P49448	558 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	SMTN	P53814	917 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	WNT7B	P56706	349 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	STRN3	Q13033	797 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	UPP1	Q16831	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.73	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804		A0A0B4J269	797 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	AOC1	P19801	751 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	ADSS	P30520	456 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CASP10	Q92851	521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	DHX58	Q96C10	678 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.72	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	PPEF2	O14830	753 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CLDN3	O15551	220 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	TADA2A	O75478	443 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	UROD	P06132	367 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	KLRC2	P26717	231 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	HOXD13	P35453	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	TXLNA	P40222	546 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	LIG4	P49917	911 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	BICD1	Q96G01	975 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804		R4GN57	208 aa		13.71	□□□□□ -0.21
APBA2-208	ENST00000558804	ATRX	P46100	2492 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	RFPL2	O75678	378 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	B3GAT3	O94766	335 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	ADRB2	P07550	413 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	IDE	P14735	1019 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
APBA2-208	ENST00000558804	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22	3e-6	■■■■■ 137.9

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