RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556356.1

LRP1-211, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 5,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-211ENST00000556356 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 24
LRP1-211ENST00000556356 MAPTP10636 758 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 TPI1P60174 286 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 TREML2Q5T2D2 321 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ZNF677Q86XU0 584 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CFAP36Q96G28 342 aa16.18■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SLITRK3O94933 977 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 GTF2H1P32780 548 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CGRRF1Q99675 332 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CIB2O75838 187 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 URODP06132 367 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 PYROXD1Q8WU10 500 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ADGRG1Q9Y653 693 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SLC18A3Q16572 532 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 PCGF5Q86SE9 256 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SRGAP2O75044 1071 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 MCF2P10911 925 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 GHRP10912 638 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 AXLP30530 894 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CUL2Q13617 745 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ZNF235Q14590 738 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 IQCB1Q15051 598 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 DSEQ9UL01 958 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 VSIG1Q86XK7 387 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 PSMC6P62333 389 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 TMC2Q8TDI7 906 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 HPSEQ9Y251 543 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 HMBSP08397 361 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ARL4CP56559 192 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 AP1B1Q10567 949 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ASPHQ12797 758 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 DYRK4Q9NR20 520 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.16■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 APOL1O14791 398 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SPRYD7Q5W111 196 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CAPNS2Q96L46 248 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CYB561D2O14569 222 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SOX10P56693 466 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ROR1Q01973 937 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 NR1I3Q14994 352 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 FMO2Q99518 471 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 BTBD19C9JJ37 291 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 VPS39Q96JC1 886 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ZMYND10O75800 440 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 FGRP09769 529 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ST8SIA6P61647 398 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 CUL1Q13616 776 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 MYBPC2Q14324 1141 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 WDR49Q8IV35 697 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 HDAC11Q96DB2 347 aa16.15■□□□□ 0.18
LRP1-211ENST00000556356 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.15■□□□□ 0.18
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