RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHRNA1	P02708	482 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	CUL2	Q13617	745 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	DNAI1	Q9UI46	699 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	NAGPA	Q9UK23	515 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	C2CD2	Q9Y426	696 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	NAB2	Q15742	525 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF592	Q92610	1267 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	DERA	Q9Y315	318 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP8B3	O60423	1300 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYL6	P60660	151 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRPC3	Q13507	836 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	CXorf38	Q8TB03	319 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAF4B	Q92750	862 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	WDR24	Q96S15	920 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	AGPAT1	Q99943	283 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	SNTG2	Q9NY99	539 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	FANCG	O15287	622 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYP26A1	O43174	497 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	HSPA6	P17066	643 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	SNX27	Q96L92	541 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARID3A	Q99856	593 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	SIX4	Q9UIU6	781 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHF24	Q9UPV7	400 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCNT	O95613	3336 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A1W2PQY0	241 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	SGPL1	O95470	568 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP8	P40818	1118 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM26D	Q5JW98	314 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	THPO	P40225	353 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBR7	Q8N806	425 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CC-208	ENST00000551676	RPS6KA5	O75582	802 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CTSH	P09668	335 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNFAIP3	P21580	790 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHST12	Q9NRB3	414 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CAND2	O75155	1236 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHRNB2	P17787	502 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CASQ1	P31415	396 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB6	Q15916	424 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	INTU	Q9ULD6	942 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYP11B1	P15538	503 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATIC	P31939	592 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF699	Q32M78	642 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	XKR4	Q5GH76	650 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CNTN3	Q9P232	1028 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	HES2	Q9Y543	173 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	CENPF	P49454	3210 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	RECQL4	O94761	1208 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	KRT5	P13647	590 aa		27.61	■■■□□ 2.01

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