RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 USP20Q9Y2K6 914 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ATP8B3O60423 1300 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ANO9A1A5B4 782 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZNF233A6NK53 670 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 K7ERI5 159 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.081e-6■■■■□ 23.8
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CS-204ENST00000546621 ADCY3O60266 1144 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 EVI5O60447 810 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RNF40O75150 1001 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GFPT2O94808 682 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MOCS3O95396 460 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PAX3P23760 479 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCT5P48643 541 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 APLP1P51693 650 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PPFIA1Q13136 1202 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SNX1Q13596 522 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LAMC2Q13753 1193 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CAPSQ13938 189 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GRB14Q14449 540 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 IER5Q5VY09 327 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 KRT39Q6A163 491 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GPR142Q7Z601 462 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LZICQ8WZA0 190 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCDC114Q96M63 670 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 EPAS1Q99814 870 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PTPN18Q99952 460 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.33□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ENC1O14682 589 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 HBP1O60381 514 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 E2F6O75461 281 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 MAPK4P31152 587 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CHMP4BP1P59074 171 aa8.33□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 CASP8Q14790 479 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NAB2Q15742 525 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CST9Q5W186 159 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TNS4Q8IZW8 715 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NOX5Q96PH1 765 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 KATNBL1Q9H079 304 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 EBF2Q9HAK2 575 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.33□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 BUB1O43683 1085 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 LRRN2O75325 713 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 GPC3P51654 580 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 EFNA5P52803 228 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 HUNKP57058 714 aa8.32□□□□□ -1.08
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