RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL23Q86XA0 190 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP57Q86XR8 500 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 KIF12Q96FN5 646 aa6.1□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CDT1Q9H211 546 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ASB7Q9H672 318 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.1□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 PANK4Q9NVE7 773 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 CNTN3Q9P232 1028 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.1□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.1□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 TBX10O75333 385 aa6.09□□□□□ -1.43
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CLSTN3-215ENST00000544584 USP28Q96RU2 1077 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC1BQ9P126 229 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0B4J269 797 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6C75A6NL08 312 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PRRG1O14668 218 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF197O14709 1029 aa6.08□□□□□ -1.44
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