RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542264.1

ARAP1-215, Transcript of ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 1, human

TSL 3

Gene ARAP1, Length 271 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARAP1-215	ENST00000542264	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	NBR1	Q14596	966 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	DAW1	Q8N136	415 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	APPL2	Q8NEU8	664 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SFI1	A8K8P3	1242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264		I3L4J1	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SLC16A4	O15374	487 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CLDN3	O15551	220 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	TBC1D4	O60343	1298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	RHO	P08100	348 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	PLS3	P13797	630 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CDC25A	P30304	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MAGEA9	P43362	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	BRCC3	P46736	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	IL17A	Q16552	155 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	KYAT1	Q16773	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MCTP1	Q6DN14	999 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	IQCE	Q6IPM2	695 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ELMOD1	Q8N336	334 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CEP120	Q8N960	986 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	FRYL	O94915	3013 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CACNA1G	O43497	2377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	DMD	P11532	3685 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SLC26A4	O43511	780 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CLTA	P09496	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SP9	P0CG40	484 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ARPP19	P56211	112 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ROR1	Q01973	937 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MAPK7	Q13164	816 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	HYI	Q5T013	277 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	SUSD3	Q96L08	255 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	KIF2C	Q99661	725 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	FOXQ1	Q9C009	403 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZNF292	O60281	2723 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264		H3BQV1	296 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ABLIM1	O14639	778 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	PAX3	P23760	479 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ABCD1	P33897	745 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ID4	P47928	161 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	MCL1	Q07820	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	RABEP1	Q15276	862 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARAP1-215	ENST00000542264	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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