RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 EVPLQ92817 2033 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 P4HA2O15460 535 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TEX33O43247 280 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 LRRN2O75325 713 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 DGKIO75912 1065 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 FGBP02675 491 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 LINC00271P0C7V0 271 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 MRE11P49959 708 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 GATMP50440 423 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 MXI1P50539 228 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 SCNN1GP51170 649 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF75DP51815 510 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 AP3M2P53677 418 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 KCNMA1Q12791 1236 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ADGRE1Q14246 886 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 RAB30Q15771 203 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 KRT39Q6A163 491 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 HACE1Q8IYU2 909 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 PPM1EQ8WY54 764 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 SEMA4DQ92854 862 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 CASD1Q96PB1 797 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 VPS16Q9H269 839 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 IFNKQ9P0W0 207 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 PARP2Q9UGN5 583 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 MSRAQ9UJ68 235 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.46□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1W2PQC6 194 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ANO9A1A5B4 782 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 PPEF2O14830 753 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 EPHB6O15197 1021 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 STX10O60499 249 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 SERPINC1P01008 464 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 AMHP03971 560 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 MYOGP15173 224 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 CYP3A5P20815 502 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 LRPAP1P30533 357 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 GUCY2FP51841 1108 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 RABGGTBP53611 331 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 MYL7Q01449 175 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 GRIK3Q13003 919 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 USP37Q86T82 979 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 RNF169Q8NCN4 708 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 HELQQ8TDG4 1101 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 KIF12Q96FN5 646 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 FNBP1Q96RU3 617 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 SIX2Q9NPC8 291 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ZBBXA8MT70 800 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 PIRO00625 290 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 HOXA2O43364 376 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 NOL4O94818 638 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 DDHD2O94830 711 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 GJB5O95377 273 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 EFEMP2O95967 443 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 HLA-DRAP01903 254 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 ACTN1P12814 892 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 TNNI1P19237 187 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 SLC9A1P19634 815 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 IGFBP4P22692 258 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 PON1P27169 355 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 KLK7P49862 253 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 UBASH3AP57075 661 aa8.44□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 APBA1Q02410 837 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms