RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	C3orf20	Q8ND61	904 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	TMX3	Q96JJ7	454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ARMT1	Q9H993	441 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	NCDN	Q9UBB6	729 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	POLH	Q9Y253	713 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PXDN	Q92626	1479 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ABCA3	Q99758	1704 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ANO9	A1A5B4	782 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CFAP69	A5D8W1	941 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089		A6NNZ2	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089		H3BUI4	141 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SLC16A6	O15403	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	MGEA5	O60502	916 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	GLDC	P23378	1020 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PTPN7	P35236	360 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CTSW	P56202	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CDC42EP1	Q00587	391 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	RNF220	Q5VTB9	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089		Q6ZUG5	572 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ING3	Q9NXR8	418 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	KCTD3	Q9Y597	815 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SLIT2	O94813	1529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	TECPR2	O15040	1411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	GLI3	P10071	1580 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SGTA	O43765	313 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL18	O94889	574 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SMARCA1	P28370	1054 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	IL12RB1	P42701	662 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	MAP2K6	P52564	334 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	DSC2	Q02487	901 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	DUSP2	Q05923	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	GALE	Q14376	348 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SSPN	Q14714	243 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SEPT2	Q15019	361 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6	6e-8	■■□□□ 12.3
MDM2-223	ENST00000536089	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	LPP	Q93052	612 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CD320	Q9NPF0	282 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGEF10	O15013	1369 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6

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