RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	PSMD5	Q16401	504 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC30A4	O14863	429 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	NRL	P54845	237 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	GSE1	Q14687	1217 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	LPAL2	Q16609	132 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	FGF13	Q92913	245 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	SNX21	Q969T3	373 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CSRP1-213	ENST00000530120		A0A087WWV3	80 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120		K7ERI5	159 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	TGM1	P22735	817 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	GRM5	P41594	1212 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	NTHL1	P78549	312 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	PTGDR	Q13258	359 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	NELL1	Q92832	810 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	CCL16	O15467	120 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	LRP3	O75074	770 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	C8A	P07357	584 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	RET	P07949	1114 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	LIG1	P18858	919 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	SCP2	P22307	547 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	FGFR3	P22607	806 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	RAB33A	Q14088	237 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	RABEP1	Q15276	862 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	F5	P12259	2224 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120		H0YCG3	227 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC26A4	O43511	780 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	B3GAT3	O94766	335 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	EDN1	P05305	212 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	MCF2	P10911	925 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	NPTX2	P47972	431 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	MTAP	Q13126	283 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	ECM1	Q16610	540 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	UPP1	Q16831	310 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSRP1-213	ENST00000530120	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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