RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519617.1

CCNC-208, Transcript of cyclin C, human

TSL 3

Gene CCNC, Length 246 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNC-208	ENST00000519617	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	KDM6B	O15054	1643 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	KIF15	Q9NS87	1388 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	HFM1	A2PYH4	1435 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ATP10A	O60312	1499 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ADGRL2	O95490	1459 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	TSPOAP1	O95153	1857 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	LCHN	A4D1U4	455 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	FAM83G	A6ND36	823 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	WIPF3	A6NGB9	483 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ZFPL1	O95159	310 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	CXADR	P78310	365 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	TERF2	Q15554	542 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF425	Q6IV72	752 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	MED25	Q71SY5	747 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	AFAP1	Q8N556	730 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF366	Q8N895	744 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF480	Q8WV37	535 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	NACC2	Q96BF6	587 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	C8orf37	Q96NL8	207 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	TIMP4	Q99727	224 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	ANO3	Q9BYT9	981 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	CASS4	Q9NQ75	786 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	DMTF1	Q9Y222	760 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CCNC-208	ENST00000519617	RPTOR	Q8N122	1335 aa		2.59	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		2.59	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		2.59	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ABCC5	O15440	1437 aa		2.59	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	NCOA1	Q15788	1441 aa		2.59	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	A2M	P01023	1474 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	MBD5	Q9P267	1494 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ATP7A	Q04656	1500 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PLXNC1	O60486	1568 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KDM5C	P41229	1560 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	IKBKB	O14920	756 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KIF3B	O15066	747 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KPNA6	O60684	536 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PHF2	O75151	1096 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	FGFR4	P22455	802 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	GCSH	P23434	173 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PROK1	P58294	105 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	OCRL	Q01968	901 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CYP2A13	Q16696	494 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	DRC7	Q8IY82	874 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	LNX2	Q8N448	690 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RNF31	Q96EP0	1072 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	UROC1	Q96N76	676 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		2.58	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	RERE	Q9P2R6	1566 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	CCDC78	A2IDD5	438 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ADCY6	O43306	1168 aa		2.57	□□□□□ -2
CCNC-208	ENST00000519617	ASMTL	O95671	621 aa		2.57	□□□□□ -2

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