RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 NACC2Q96BF6 587 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFSD3Q96ES6 412 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 PGBD1Q96JS3 809 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF778Q96MU6 729 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 INTS13Q9NVM9 706 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 ASB6Q9NWX5 421 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 DPP7Q9UHL4 492 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCOCQ9UIL1 159 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD2APQ9Y5K6 639 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-397P-201ENST00000516226 WIPF3A6NGB9 483 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM171A2A8MVW0 826 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 YY2O15391 372 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 LPLP06858 475 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAPQ12884 760 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTPRRQ15256 657 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 LLGL1Q15334 1064 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 DHCR24Q15392 516 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADRM1Q16186 407 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CT83Q5H943 113 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 KAZNQ674X7 775 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 VWA1Q6PCB0 445 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 REPS2Q8NFH8 660 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SIK3Q9Y2K2 1263 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 LCHNA4D1U4 455 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 BMP15O95972 392 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 BPIP17213 487 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CANXP27824 592 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALDH1A3P47895 512 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MUM1Q2TAK8 710 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM153CQ494X1 144 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF529Q6P280 563 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q6ZVL8 140 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDPRQ8NCN5 879 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP7Q93009 1102 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MS4A5Q9H3V2 200 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRDM12Q9H4Q4 367 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MANSC1Q9H8J5 431 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 IFT122Q9HBG6 1241 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP25Q9UHP3 1055 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR91A4D1P6 747 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC01548A6NM66 108 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRAMEF10O60809 474 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR32O75388 356 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CERS1P27544 350 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC5A3P53794 718 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 NXPH1P58417 271 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MGAT2Q10469 447 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MALLQ13021 153 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 GEN1Q17RS7 908 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 DACT2Q5SW24 774 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FBXL20Q96IG2 436 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ORAI2Q96SN7 254 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADI1Q9BV57 179 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 IFT22Q9H7X7 185 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 AATKQ6ZMQ8 1374 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 E7ENX8 843 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 HAUS5O94927 633 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAPK10P53779 464 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TUBA4AP68366 448 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDK17Q00537 523 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 CREMQ03060 361 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TAP2Q03519 686 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITIH3Q06033 890 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDCD1Q15116 288 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MORN5Q5VZ52 161 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TSPEARQ8WU66 669 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TTC1Q99614 292 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 KANSL2Q9H9L4 492 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-397P-201ENST00000516226 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms