RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	PARVG	Q9HBI0	331 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	RAD54L	Q92698	747 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	BICD1	Q96G01	975 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	CDH7	Q9ULB5	785 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195		I3L4J1	428 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	CCL16	O15467	120 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	ABLIM3	O94929	683 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	FAM13A	O94988	1023 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	PIGR	P01833	764 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	PLCG1	P19174	1290 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	AOC1	P19801	751 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	HTR4	Q13639	388 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	MYCT1	Q8N699	235 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	SUSD3	Q96L08	255 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	TBX20	Q9UMR3	447 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNF8-208	ENST00000510195	USP34	Q70CQ2	3546 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	TTC26	A0AVF1	554 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	TRAK2	O60296	914 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	TBC1D4	O60343	1298 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	NPR3	P17342	541 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	DDIT3	P35638	169 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	LIG4	P49917	911 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	SIX5	Q8N196	739 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	APPL2	Q8NEU8	664 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	FLCN	Q8NFG4	579 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	POLI	Q9UNA4	740 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	CYP3A5	P20815	502 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ROR1	Q01973	937 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	MCM6	Q14566	821 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	LRRC15	Q8TF66	581 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	MAFF	Q9ULX9	164 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	CXCL8	P10145	99 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ATF2	P15336	505 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	LRPAP1	P30533	357 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ELF1	P32519	619 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	GRIN1	Q05586	938 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ZBTB6	Q15916	424 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	SEZ6	Q53EL9	994 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	TPGS2	Q68CL5	300 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	MTSS1L	Q765P7	747 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	FGF13	Q92913	245 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195		K7ENM7	598 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	OGT	O15294	1046 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ADRB2	P07550	413 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	CFH	P08603	1231 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	NTHL1	P78549	312 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	GTF2B	Q00403	316 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	CD302	Q8IX05	232 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	PHOX2B	Q99453	314 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	WDR27	A2RRH5	827 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195		H0Y858	1186 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	MCM4	P33991	863 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	PTPA	Q15257	358 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF280D	Q6N043	979 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195		M0QZQ0	153 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	FAM189A1	O60320	539 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	LRG1	P02750	347 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SNF8-208	ENST00000510195	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms