RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 MAPK10P53779 464 aa2.61□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 ADCK5Q3MIX3 580 aa2.61□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 C3orf36Q3SXR2 165 aa2.61□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 CD109Q6YHK3 1445 aa2.61□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 NCK2O43639 380 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 NR1I3Q14994 352 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 VSIG10LQ86VR7 867 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 RTP1P59025 263 aa2.6□□□□□ -1.99
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PDE4D-218ENST00000509368 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 NUP133Q8WUM0 1156 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 RFFLQ8WZ73 363 aa2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PDE4D-218ENST00000509368 TSPAN17Q96FV3 270 aa2.6□□□□□ -1.99
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