RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 A0A087X1B8 175 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC154A6NI56 674 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MARCH11A6NNE9 402 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 RAMP2O60895 175 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ELANEP08246 267 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 EDNRBP24530 442 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 RSPH3Q86UC2 560 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 KAT5Q92993 513 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CEP89Q96ST8 783 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ADAM2Q99965 735 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 DKK2Q9UBU2 259 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC78A2IDD5 438 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CDHR4A6H8M9 788 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 FOXN1O15353 648 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CFIP05156 583 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ALAS1P13196 640 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 GCSHP23434 173 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 BMPR1AP36894 532 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CDC42EP1Q00587 391 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CREMQ03060 361 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 OCA2Q04671 838 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 RESTQ13127 1097 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TP53BP2Q13625 1128 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 COA7Q96BR5 231 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 USP25Q9UHP3 1055 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1B0GTW7 788 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 HLA-DOAP06340 250 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 FGFR4P22455 802 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 CCND1P24385 295 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 CTXN1P60606 82 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 HSD11B2P80365 405 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 GUCY1B3Q02153 619 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 ATP2B3Q16720 1220 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 PCSK4Q6UW60 755 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 IFI44Q8TCB0 444 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 SUV39H1O43463 412 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 SGTAO43765 313 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 B3GALT2O43825 422 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 CDKL5O76039 1030 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 SPDEFO95238 335 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 SBK3P0C264 359 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A4P31645 630 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 NOMO3P69849 1222 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 DACT2Q5SW24 774 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 SMC5Q8IY18 1101 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 FITM2Q8N6M3 262 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 ASB10Q8WXI3 467 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 AGAP2Q99490 1192 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 GRM6O15303 877 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 CKBP12277 381 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 MXRA7P84157 204 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 Q6YL49 198 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 PMM1Q92871 262 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 RNF31Q96EP0 1072 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-215ENST00000506510 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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