RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 MAPK4P31152 587 aa11.58□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 CUL2Q13617 745 aa11.58□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.58□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 PLXNB2O15031 1838 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 MCM3APO60318 1980 aa11.58□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 B4GALT4O60513 344 aa11.57□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 GJB1P08034 283 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXC6P09630 235 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 IQCF3P0C7M6 154 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 PIK3CAP42336 1068 aa11.57□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 PDE6CP51160 858 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF132P52740 706 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 BIRC3Q13489 604 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 ACVR2BQ13705 512 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 NCOA4Q13772 614 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 MORN1Q5T089 497 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 DPP9Q86TI2 863 aa11.57□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 CEP104O60308 925 aa11.56□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP4Q96MN2 994 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 TCHPQ9BT92 498 aa11.56□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.56□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.56□□□□□ -0.56
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BRB1 525 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 PHACTR2O75167 634 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHA2P01877 340 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 MCF2P10911 925 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMC4P43686 418 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 PHKA2P46019 1235 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 PEX5P50542 639 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP2-209ENST00000504450 TNNC1P63316 161 aa11.55□□□□□ -0.56
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