RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 TDP2O95551 362 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 POMCP01189 267 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 CAPNS1P04632 268 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 PDE6CP51160 858 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 HYIQ5T013 277 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 ITIH5Q86UX2 942 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 ITFG1Q8TB96 612 aa8.5□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 REC8O95072 547 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 RPA1P27694 616 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 CDC25AP30304 524 aa8.5□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD1Q15327 319 aa8.5□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 DSEQ9UL01 958 aa8.5□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF263O14978 683 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 ADAMTS3O15072 1205 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 SLC37A4O43826 429 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 LRG1P02750 347 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF280DQ6N043 979 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 RXRAP19793 462 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 ERMNQ8TAM6 284 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 DYDC2Q96IM9 177 aa8.49□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 CITO14578 2027 aa8.49□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 CDC25CP30307 473 aa8.48□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.48□□□□□ -1.05
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PDE4D-210ENST00000503258 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-210ENST00000503258 USP18Q9UMW8 372 aa8.48□□□□□ -1.05
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