RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 CLEC1BQ9P126 229 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.18□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 PLXNA3P51805 1871 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 CARNS1A5YM72 827 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 EXTL3O43909 919 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 RPL17P18621 184 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 GLUD2P49448 558 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 CYP2J2P51589 502 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 DSG1Q02413 1049 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 SPATA1Q5VX52 437 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 ISM2Q6H9L7 571 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 KANK3Q6NY19 840 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 CEP57Q86XR8 500 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 GLYCTKQ8IVS8 523 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 BRSK2Q8IWQ3 736 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 GPD1LQ8N335 351 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 EFHBQ8N7U6 833 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 TIGD1Q96MW7 591 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 UROC1Q96N76 676 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 KCTD10Q9H3F6 313 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 COG5Q9UP83 839 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 IRAK3Q9Y616 596 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 UBE4BO95155 1302 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 ADAM12O43184 909 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 URODP06132 367 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 EPCAMP16422 314 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 LRPAP1P30533 357 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 KCNB1Q14721 858 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 TMEM132DQ14C87 1099 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 USP41Q3LFD5 358 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 APOL5Q9BWW9 433 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 ASB7Q9H672 318 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 SCN1AP35498 2009 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 PTPRJQ12913 1337 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 SPTLC1O15269 473 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 TEX28O15482 410 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 KINO60870 393 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 NDUFV1P49821 464 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 UBE2HP62256 183 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 CD302Q8IX05 232 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 SPATA20Q8TB22 786 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 MSLNLQ96KJ4 702 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 FBXL18Q96ME1 805 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 ASB2Q96Q27 587 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 CDH22Q9UJ99 828 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-210ENST00000488157 ZNF233A6NK53 670 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 IL18RAPO95256 599 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 SPATA31D3P0C874 917 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 BMP1P13497 986 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 CYP3A5P20815 502 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 FGFR3P22607 806 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 KLRC2P26717 231 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 MCM4P33991 863 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 PRCPP42785 496 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 CASP4P49662 377 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 SYCE2Q6PIF2 218 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 PALB2Q86YC2 1186 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 C12orf56Q8IXR9 622 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 XXYLT1Q8NBI6 393 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 BEST2Q8NFU1 509 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 SMARCE1Q969G3 411 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 CLSTN3Q9BQT9 956 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 TTPALQ9BTX7 342 aa13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NISCH-210ENST00000488157 RXFP1Q9HBX9 757 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms