RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ACP6Q9NPH0 428 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 SIX4Q9UIU6 781 aa19.5■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 STX10O60499 249 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 GTF2H1P32780 548 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 NCOA4Q13772 614 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 RAD9BQ6WBX8 426 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 SNX27Q96L92 541 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 KREMEN1Q96MU8 473 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 HIPK3Q9H422 1215 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 CITO14578 2027 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 SCN5AQ14524 2016 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PQJ5 194 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 PPEF2O14830 753 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ITGB8P26012 769 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 CETN1Q12798 172 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DSC3Q14574 896 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DEFB128Q7Z7B8 93 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC112Q8NEF3 446 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 LINC01599Q8WXQ3 324 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 RABGGTAQ92696 567 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 PANX2Q96RD6 677 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 MIOSQ9NXC5 875 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 NUB1Q9Y5A7 615 aa19.49■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DCDC2CA8MYV0 355 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ITGB3P05106 788 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM132DQ14C87 1099 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DBF4BQ8NFT6 615 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 CAGE1Q8TC20 777 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 HELQQ8TDG4 1101 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 SPAG5Q96R06 1193 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DESI2Q9BSY9 194 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 OGFRQ9NZT2 677 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 A0A0U1RQJ8 604 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 P4HA2O15460 535 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 IL18RAPO95256 599 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ATRIPQ8WXE1 791 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 GAD1Q99259 594 aa19.48■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 GFPT2O94808 682 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 MLH1P40692 756 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 YARSP54577 528 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 CBX1P83916 185 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 BFSP2Q13515 415 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 AGMOQ6ZNB7 445 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 CXorf38Q8TB03 319 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 USP27XA6NNY8 438 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 PMM2O15305 246 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 USP8P40818 1118 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 JAM2P57087 298 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 NYAP1Q6ZVC0 841 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ASB7Q9H672 318 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 CHST12Q9NRB3 414 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa19.47■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 PTGESO14684 152 aa19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 TLR3O15455 904 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 TNNC2P02585 160 aa19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DNAAF5Q86Y56 855 aa19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 GSTCDQ8NEC7 633 aa19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM39AQ9NV64 488 aa19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DPP3Q9NY33 737 aa19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 POLIQ9UNA4 740 aa19.46■□□□□ 0.71
ATG4B-217ENST00000475693 CAND2O75155 1236 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 TRPC3Q13507 836 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 SURF1Q15526 300 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 HGSNATQ68CP4 663 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 NT5C1BQ96P26 610 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 PRDM10Q9NQV6 1147 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 TFR2Q9UP52 801 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 AGAP1Q9UPQ3 857 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 F8VZ95 297 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 ITGA4P13612 1032 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 NOP14P78316 857 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 ENPEPQ07075 957 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 NECAB2Q7Z6G3 386 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 XYLT2Q9H1B5 865 aa19.45■□□□□ 0.7
ATG4B-217ENST00000475693 CNTN3Q9P232 1028 aa19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms