RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
FBXO18-208	ENST00000470089	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		31.89	■■■□□ 2.7
FBXO18-208	ENST00000470089	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		31.89	■■■□□ 2.7
FBXO18-208	ENST00000470089	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		31.89	■■■□□ 2.7
FBXO18-208	ENST00000470089	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	GLUD1	P00367	558 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA31D3	P0C874	917 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	ITIH3	Q06033	890 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	PSMD5	Q16401	504 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A1B0GVL5	298 aa		31.87	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	ADSS	P30520	456 aa		31.87	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	AFM	P43652	599 aa		31.87	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		31.87	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		31.87	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		31.87	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	FGFR3	P22607	806 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	GUCY2F	P51841	1108 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	CREM	Q03060	361 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	ALCAM	Q13740	583 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	TRAPPC3	O43617	180 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	PFKFB1	P16118	471 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBTB6	Q15916	424 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	POMK	Q9H5K3	350 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAM12	O43184	909 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	TGM5	O43548	720 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	CMA1	P23946	247 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	POSTN	Q15063	836 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	JADE1	Q6IE81	842 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	ADRB2	P07550	413 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	CUL4B	Q13620	913 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
FBXO18-208	ENST00000470089	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	NFIC	P08651	508 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	MCM4	P33991	863 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	MTHFR	P42898	656 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	PDXDC1	Q6P996	788 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	UNC13D	Q70J99	1090 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	SAAL1	Q96ER3	474 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	RFPL2	O75678	378 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	SLFN14	P0C7P3	912 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP3A5	P20815	502 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	LRPAP1	P30533	357 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	LILRA6	Q6PI73	481 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	CD302	Q8IX05	232 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM206	Q9H813	350 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	MTRR	Q9UBK8	725 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	HPSE	Q9Y251	543 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	GPR149	Q86SP6	731 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	PAGE5	Q96GU1	130 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	DPP7	Q9UHL4	492 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	OR1D2	P34982	312 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA1	Q5VX52	437 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		31.79	■■■□□ 2.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms