RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454741.5

TTC28-AS1-219, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,064 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TC2NQ8N9U0 490 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PGBD4Q96DM1 585 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OTUD5Q96G74 571 aa16.06■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MTSS1O43312 755 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NR3C2P08235 984 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRC14Q15048 493 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DLC1Q96QB1 1528 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HADHAP40939 763 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MAP3K10Q02779 954 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FAM151AQ8WW52 585 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SIK2Q9H0K1 926 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RSAD1Q9HA92 442 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KCNN4O15554 427 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PDHBP11177 359 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 APPL2Q8NEU8 664 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 POLIQ9UNA4 740 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RASA1P20936 1047 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PGM1P36871 562 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HMGCS2P54868 508 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 INPP5AQ14642 412 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CPB1P15086 417 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KCNA2P16389 499 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FGFR4P22455 802 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RAD23BP54727 409 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SCFD2Q8WU76 684 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PTPRMP28827 1452 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FAM47DPA6NHR8 397 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMED1Q13445 227 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CALML6Q8TD86 181 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KCNK16Q96T55 309 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KLC4Q9NSK0 619 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC25A27O95847 323 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MUTP22033 750 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STYK1Q6J9G0 422 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RMDN1Q96DB5 314 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HACL1Q9UJ83 578 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CAMTA2O94983 1202 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ANTXR2P58335 489 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STX3Q13277 289 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RABGAP1LQ5R372 815 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KRT4P19013 534 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GRAMD4Q6IC98 578 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KLHL2O95198 593 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SULT1E1P49888 294 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GUCY1A3Q02108 690 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ATP9BO43861 1147 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms