RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441455.1

RPSAP20-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP20, Length 890 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP20-201ENST00000441455 RNF39Q9H2S5 420 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 RNF19AQ9NV58 838 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 MYO6Q9UM54 1294 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 C2CD2Q9Y426 696 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SERPING1P05155 500 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SOX5P35711 763 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 USP8P40818 1118 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 RAB27AP51159 221 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 MYL6P60660 151 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 TLE2Q04725 743 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 DSC3Q14574 896 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF699Q32M78 642 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 RNF169Q8NCN4 708 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 BEST2Q8NFU1 509 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 LPPQ93052 612 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ADAM2Q99965 735 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 DESI2Q9BSY9 194 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 GPR88Q9GZN0 384 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 HIPK3Q9H422 1215 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 DEF6Q9H4E7 631 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 DPP3Q9NY33 737 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 AIPL1Q9NZN9 384 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 CNTN3Q9P232 1028 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 DERAQ9Y315 318 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SCN5AQ14524 2016 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 PITPNM1O00562 1244 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 NBNO60934 754 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 FERP16591 822 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 MLH1P40692 756 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 KCNJ6P48051 423 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 CCL23P55773 120 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 CDK17Q00537 523 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 FAAP100Q0VG06 881 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SCLYQ96I15 445 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 FAM81BQ96LP2 452 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SIX4Q9UIU6 781 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 USP27XA6NNY8 438 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 XPOTO43592 962 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 AKR1B10O60218 316 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 EVI5O60447 810 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 SKIP12755 728 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 KRT5P13647 590 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 KIF11P52732 1056 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 GCNT1Q02742 428 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 CUL2Q13617 745 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 HGSNATQ68CP4 663 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ALKAL1Q6UXT8 129 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 PGBD4Q96DM1 585 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 CCDC42Q96M95 316 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ZFP42Q96MM3 310 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 TOX2Q96NM4 488 aa11.34□□□□□ -0.59
RPSAP20-201ENST00000441455 ARID3AQ99856 593 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms