RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.34■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.34■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 ELF1P32519 619 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 DDIT3P35638 169 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 TXLNAP40222 546 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 NTHL1P78549 312 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 UVSSAQ2YD98 709 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 FAM212AQ96EL1 285 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 KIF12Q96FN5 646 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 MYH11P35749 1972 aa21.33■■□□□ 1.01
NPAS1-201ENST00000439365 H7C4K7 107 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 STK25O00506 426 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 SYN3O14994 580 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 PAPLNO95428 1278 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 CFHP08603 1231 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 LAMP2P13473 410 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 SCP2P22307 547 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 HOXA9P31269 272 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 TNFSF9P41273 254 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF131P52739 623 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 RESTQ13127 1097 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 USP49Q70CQ1 688 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 DYMQ7RTS9 669 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 SIX5Q8N196 739 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 CLIC6Q96NY7 704 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 TRIP11Q15643 1979 aa21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 RFX1P22670 979 aa21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ROR1Q01973 937 aa21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 PTPAQ15257 358 aa21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 KYAT1Q16773 422 aa21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 VWA8A3KMH1 1905 aa21.31■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 PRRG1O14668 218 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 OGTO15294 1046 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ABCD1P33897 745 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 MRE11P49959 708 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 TCF15Q12870 199 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 APPL2Q8NEU8 664 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 NXPE3Q969Y0 559 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 TTC26A0AVF1 554 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 LACTBL1A8MY62 500 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 LRG1P02750 347 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF280DQ6N043 979 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 SUSD3Q96L08 255 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 STK17AQ9UEE5 414 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 CDH7Q9ULB5 785 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 WDR27A2RRH5 827 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 STX6O43752 255 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 PIGRP01833 764 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 GTF2BQ00403 316 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 SV2BQ7L1I2 683 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 RTL10Q7L3V2 364 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ITFG1Q8TB96 612 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 DDX12PQ92771 950 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 PANK2Q9BZ23 570 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.29■■□□□ 1
NPAS1-201ENST00000439365 CA14Q9ULX7 337 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms