RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 UBA7P41226 1012 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF131P52739 623 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 ROR1Q01973 937 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 UVSSAQ2YD98 709 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 GPBP1Q86WP2 473 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 SIX5Q8N196 739 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 FLCNQ8NFG4 579 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 CALML4Q96GE6 196 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 WNT16Q9UBV4 365 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.97■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 SYN3O14994 580 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 CLDN3O15551 220 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 CXCL8P10145 99 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 PLCG1P19174 1290 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 RTL10Q7L3V2 364 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 FIZ1Q96SL8 496 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 CDH7Q9ULB5 785 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 POLIQ9UNA4 740 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.96■■□□□ 1.11
HLA-B-250ENST00000434333 TTC26A0AVF1 554 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 WDR27A2RRH5 827 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 FAM189A1O60320 539 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 XYLBO75191 536 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 PIGRP01833 764 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 TNFSF9P41273 254 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 MCM6Q14566 821 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ITFG1Q8TB96 612 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 RAD54LQ92698 747 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 FGF13Q92913 245 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 FGF14Q92915 247 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 SUSD3Q96L08 255 aa21.95■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.95■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 H0YCG3 227 aa21.94■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 PTPAQ15257 358 aa21.94■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB6Q15916 424 aa21.94■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 PARM1Q6UWI2 310 aa21.94■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.94■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 GPR152Q8TDT2 470 aa21.94■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 TBX20Q9UMR3 447 aa21.94■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.94■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.94■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.93■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 CLTAP09496 248 aa21.93■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 USP49Q70CQ1 688 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 BICD1Q96G01 975 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 PARVGQ9HBI0 331 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 CA14Q9ULX7 337 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 CLIC4Q9Y696 253 aa21.93■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 TRAK2O60296 914 aa21.92■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 FAM13AO94988 1023 aa21.92■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ATF2P15336 505 aa21.92■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 LRPAP1P30533 357 aa21.92■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 LIG4P49917 911 aa21.92■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 RESTQ13127 1097 aa21.92■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.92■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.92■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 MYCT1Q8N699 235 aa21.92■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.92■■□□□ 1.1
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HLA-B-250ENST00000434333 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 SEC24AO95486 1093 aa21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ADRB2P07550 413 aa21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 SCP2P22307 547 aa21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 MCM4P33991 863 aa21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 SPECC1Q5M775 1068 aa21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 EPSTI1Q96J88 318 aa21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HLA-B-250ENST00000434333 DMDP11532 3685 aa21.91■■□□□ 1.1
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