RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.33□□□□□ -1.24
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HOXD8-202ENST00000429017 MIOSQ9NXC5 875 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 VAV3Q9UKW4 847 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.33□□□□□ -1.24
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HOXD8-202ENST00000429017 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 DMDP11532 3685 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 NRP1O14786 923 aa7.32□□□□□ -1.24
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HOXD8-202ENST00000429017 RAB27AP51159 221 aa7.31□□□□□ -1.24
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HOXD8-202ENST00000429017 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.31□□□□□ -1.24
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HOXD8-202ENST00000429017 TEX28O15482 410 aa7.3□□□□□ -1.24
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HOXD8-202ENST00000429017 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.3□□□□□ -1.24
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HOXD8-202ENST00000429017 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.3□□□□□ -1.24
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HOXD8-202ENST00000429017 SIX5Q8N196 739 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 PGBD4Q96DM1 585 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 CPB2Q96IY4 423 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 CEP170P1Q96L14 293 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 B3GALT6Q96L58 329 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 RGL1Q9NZL6 768 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 CACNG4Q9UBN1 327 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD8-202ENST00000429017 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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