RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411249.1

RNU6-1199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1199P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1199P-201ENST00000411249 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FPGSQ05932 587 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MALLQ13021 153 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 STAT4Q14765 748 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NOMO2Q5JPE7 1267 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KAZNQ674X7 775 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RSPH3Q86UC2 560 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 AMOTL1Q8IY63 956 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ATL2Q8NHH9 583 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LMBR1Q8WVP7 490 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DPF2Q92785 391 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NACC2Q96BF6 587 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CYFIP2Q96F07 1278 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FBXL20Q96IG2 436 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC2A13Q96QE2 648 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PNKPQ96T60 521 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C7orf25Q9BPX7 421 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MANSC1Q9H8J5 431 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CPNE5Q9HCH3 593 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 VTA1Q9NP79 307 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ASB6Q9NWX5 421 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 USP35Q9P2H5 1018 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC17A6Q9P2U8 582 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KCNE5Q9UJ90 142 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 INTUQ9ULD6 942 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SIK3Q9Y2K2 1263 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ATRNL1Q5VV63 1379 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 WASHC2AQ641Q2 1341 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CDHR4A6H8M9 788 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MYADML2A6NDP7 307 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LRRC3CA6NJW4 275 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MARCH11A6NNE9 402 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 WNT10BO00744 389 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 YY2O15391 372 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DDCP20711 480 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PCSK1P29120 753 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MCAMP43121 646 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 VAV2P52735 878 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CACNA2D1P54289 1103 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PPP3CAQ08209 521 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CYP2A13Q16696 494 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GEN1Q17RS7 908 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ANO4Q32M45 955 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RNF180Q86T96 592 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMEM125Q96AQ2 219 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MED15Q96RN5 788 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KLK15Q9H2R5 256 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PRDM13Q9H4Q3 707 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMEM74BQ9NUR3 256 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KCTD5Q9NXV2 234 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC23A1Q9UHI7 598 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CCDC78A2IDD5 438 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FAM171A2A8MVW0 826 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GUCY1A2P33402 732 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF844Q08AG5 666 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SCAPQ12770 1279 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ACAP2Q15057 778 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FAM153CQ494X1 144 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TSTD2Q5T7W7 516 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KCNK18Q7Z418 384 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 WDR66Q8TBY9 1149 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SSH3Q8TE77 659 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NUP133Q8WUM0 1156 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TFAP2BQ92481 460 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SEMA4GQ9NTN9 838 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TDP1Q9NUW8 608 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RNF7Q9UBF6 113 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CDYLQ9Y232 598 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NR2E3Q9Y5X4 410 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CCDC151A5D8V7 595 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ENPP3O14638 875 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MGST3O14880 152 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 AGFG2O95081 481 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MATN4O95460 622 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ERBB2P04626 1255 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CHRM2P08172 466 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GPD1P21695 349 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FOLR3P41439 243 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GPR3P46089 330 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MGAT2Q10469 447 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SEPT2Q15019 361 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms