RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa10.73□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ACP6Q9NPH0 428 aa10.73□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 TAS2R14Q9NYV8 317 aa10.73□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 AKT3Q9Y243 479 aa10.73□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 NCANO14594 1321 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD62A6NC57 917 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 OGTO15294 1046 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM189A1O60320 539 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PHACTR2O75167 634 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 TMOD1P28289 359 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PHKA2P46019 1235 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MCL1Q07820 350 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 DGKDQ16760 1214 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ATF7IP2Q5U623 682 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 IQSEC1Q6DN90 963 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MSANTD4Q8NCY6 345 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 FZD8Q9H461 694 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 GOLPH3Q9H4A6 298 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 B4GALT5O43286 388 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 CAPN15O75808 1086 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 AP1G2O75843 785 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 VNN1O95497 513 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP11B1P15538 503 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ANK1P16157 1881 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PAFAH1B1P43034 410 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 TNFAIP2Q03169 654 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PPFIA1Q13136 1202 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP2K5Q13163 448 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MORN1Q5T089 497 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 RGMBQ6NW40 437 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 SH3GL3Q99963 347 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 THAP2Q9H0W7 228 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MINDY3Q9H8M7 445 aa10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ABLIM1O14639 778 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 ADCY6O43306 1168 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 FTLP02792 175 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MMEP08473 750 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 CHRNB2P17787 502 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PROZP22891 400 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 AP3M2P53677 418 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 RWDD2BP57060 319 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 C2orf54Q08AI8 447 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 RPS6KA1Q15418 735 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 SPOPLQ6IQ16 392 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 DAAM2Q86T65 1068 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 WDR49Q8IV35 697 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 THNSL1Q8IYQ7 743 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 SYCE1Q8N0S2 351 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 NME8Q8N427 588 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC01465Q8N7H1 131 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC35G2Q8TBE7 412 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 TAF4BQ92750 862 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PNKPQ96T60 521 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 IMPG2Q9BZV3 1241 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
LRRTM4-202ENST00000409093 MGAMO43451 1857 aa10.71□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A087WZ62 844 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 RTN2O75298 545 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 VTNP04004 478 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 FMO1Q01740 532 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CDR2Q01850 454 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 GRM1Q13255 1194 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 NCOA4Q13772 614 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SURF1Q15526 300 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 GRIK4Q16099 956 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 PTPROQ16827 1216 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 CFAP221Q4G0U5 840 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 PEX26Q7Z412 305 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF26Q96DR7 871 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SCLT1Q96NL6 688 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHB18PQ96TA0 734 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 ISCUQ9H1K1 167 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.7□□□□□ -0.7
LRRTM4-202ENST00000409093 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms