RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CNR2P34972 360 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 FAM187BQ17R55 369 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 OXER1Q8TDS5 423 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 GDAQ9Y2T3 454 aa21.28■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 MOSPD3O75425 235 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 MICAL2O94851 1124 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 EDN1P05305 212 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 ARPP19P56211 112 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 SHC2P98077 582 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PTGDRQ13258 359 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 WDR44Q5JSH3 913 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCD2Q92925 531 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 RXFP3Q9NSD7 469 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.27■■□□□ 1
HOXD12-201ENST00000404162 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 CPLX1O14810 134 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF263O14978 683 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ATF2P15336 505 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 GJA1P17302 382 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 LIMK1P53667 647 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC6Q16204 474 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 UPP1Q16831 310 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZS52 159 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 TRIP11Q15643 1979 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 FAM205CA6NFA0 338 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ARNTLO00327 626 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 AXIN1O15169 862 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 CDC45O75419 566 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 CEP68Q76N32 757 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 BAHCC1Q9P281 2608 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC3O43617 180 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 DTNBO60941 627 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 SOX9P48436 509 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 STK3Q13188 491 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 BSNDQ8WZ55 320 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 FRYQ5TBA9 3013 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ACKR2O00590 384 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 PRKCBP05771 671 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 PROS1P07225 676 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 MYL4P12829 197 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 LIG1P18858 919 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 PSMA5P28066 241 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC32Q14392 662 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 RSPRY1Q96DX4 576 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 UROC1Q96N76 676 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 CEP72Q9P209 647 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 TEAD2Q15562 447 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK6Q16659 721 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXD12-201ENST00000404162 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms