RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359253.2

CCDC197-201, Transcript of coiled-coil domain containing 197, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC197, Length 1,275 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197-201ENST00000359253 NAGPAQ9UK23 515 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 C2CD2Q9Y426 696 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 A0A1W2PQY0 241 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 MYADML2A6NDP7 307 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TREHO43280 583 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 STAG3L1P0CL83 205 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 GZMAP12544 262 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ATICP31939 592 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TNFSF9P41273 254 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CDK7P50613 346 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TUBB4BP68371 445 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TRPC3Q13507 836 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 NCOA4Q13772 614 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 KIZQ2M2Z5 673 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ACAP3Q96P50 834 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 AGPAT1Q99943 283 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 SYT11Q9BT88 431 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 NENFQ9UMX5 172 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ARVCFO00192 962 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 VNN1O95497 513 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 H2AFZP0C0S5 128 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CHMP4BP1P59074 171 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ITGA7Q13683 1181 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 H2AFVQ71UI9 128 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 DPF3Q92784 378 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 NOX5Q96PH1 765 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 PDE6CP51160 858 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CUL2Q13617 745 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 SLC35F6Q8N357 371 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TTC39CQ8N584 583 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TATDN2Q93075 761 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 FAM212AQ96EL1 285 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 WDR24Q96S15 920 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 OSMRQ99650 979 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CHST12Q9NRB3 414 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 PTPRJQ12913 1337 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 RCCD1A6NED2 376 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 LACTBL1A8MY62 500 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CAND2O75155 1236 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 LRRN2O75325 713 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TMEM253P0C7T8 217 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 P4HA1P13674 534 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 PRLRP16471 622 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 WNT7BP56706 349 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TCEAL1Q15170 157 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 SEZ6Q53EL9 994 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 SERINC5Q86VE9 423 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 CPB2Q96IY4 423 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC197-201ENST00000359253 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms