RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 COG2Q14746 738 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 PNMA1Q8ND90 353 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF217Q8TC41 542 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 UFL1O94874 794 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 HSD17B3P37058 310 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 PRCPP42785 496 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 COPAP53621 1224 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 NAT9Q9BTE0 207 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 POLD4Q9HCU8 107 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 MAFGO15525 162 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 MED26O95402 600 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH1B1P30837 517 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 STILQ15468 1287 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 RINLQ6ZS11 566 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-201ENST00000356331 STAT5AP42229 794 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 IL12RB1P42701 662 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RAP1GAPP47736 663 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINB8P50452 374 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 STAT5BP51692 787 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 KYNUQ16719 465 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF790Q6PG37 636 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SFR1Q86XK3 245 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPH1Q92598 858 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TRABDQ9H4I3 376 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PREX2Q70Z35 1606 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 M0R2C6 588 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TM9SF1O15321 606 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM35BQ8NCS4 154 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.15□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKAA2P54646 552 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 LCORLQ8N3X6 602 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 EYA1Q99502 592 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR35Q9P2L0 1181 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SASH3O75995 380 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TTLL1O95922 423 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 S100A1P23297 94 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ROR1Q01973 937 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RUBCNLQ9H714 662 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 S100ZQ8WXG8 99 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 IP6K1Q92551 441 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PHF2O75151 1096 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ALOX5P09917 674 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CPXCR1Q8N123 301 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 KLRF2D3W0D1 207 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPN1P07384 714 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CENPCQ03188 943 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 NCAPHQ15003 741 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 C2CD2Q9Y426 696 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 GJA8P48165 433 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 MMRN1Q13201 1228 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 SDE2Q6IQ49 451 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 AURKCQ9UQB9 309 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 EXT2Q93063 718 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ULK4Q96C45 1275 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 VWA5AO00534 786 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 DLGAP3O95886 979 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 BCAP31P51572 246 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMC6P62333 389 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 WASHC2DQ5SRD0 308 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 DLG3Q92796 817 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PARVAQ9NVD7 372 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF197O14709 1029 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP9AO75110 1047 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 BTKQ06187 659 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP2-201ENST00000356331 FUKQ8N0W3 1084 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms