RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 ZBED1O96006 694 aa16.44■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 ALG3Q92685 438 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 CDKL2Q92772 493 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 ZWINTO95229 277 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 SLC8A3P57103 927 aa16.44■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 SLC5A5Q92911 643 aa16.44■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 RNF146Q9NTX7 359 aa16.44■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 CASZ1Q86V15 1759 aa16.44■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 TBX20Q9UMR3 447 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 A6NJR5 290 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF699Q32M78 642 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.42■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 PPP3CAQ08209 521 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 NXNQ6DKJ4 435 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 NME8Q8N427 588 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 MYH8P13535 1937 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 GYS1P13807 737 aa16.41■□□□□ 0.22
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