RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 BCS1LQ9Y276 419 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TRIM49P0CI25 452 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TRIM49CP0CI26 452 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 DESP17661 470 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SLC16A2P36021 539 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 BICD1Q96G01 975 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 DYDC2Q96IM9 177 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SYNCQ9H7C4 482 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CLDN3O15551 220 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 KRT5P13647 590 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TAC1P20366 129 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ARL4CP56559 192 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 MAP7Q14244 749 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EPC2Q52LR7 807 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 VSTM1Q6UX27 236 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FAM160B2Q86V87 743 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ERICH1Q86X53 443 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SHC3Q92529 594 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NSL1Q96IY1 281 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 GYG2O15488 501 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EVX2Q03828 476 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ATG16L1Q676U5 607 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FITM2Q8N6M3 262 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TEKT4Q8WW24 435 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SLC5A5Q92911 643 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CD101Q93033 1021 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CCDC189A1A4V9 331 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PROSCO94903 275 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PLS3P13797 630 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ATP4AP20648 1035 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 OCRLQ01968 901 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 GCNT1Q02742 428 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CUL3Q13618 768 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CEP55Q53EZ4 464 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PADI6Q6TGC4 694 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 KRT35Q92764 455 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 MRIQ9BWK5 157 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 VPS11Q9H270 941 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 VAV3Q9UKW4 847 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms