RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRABD2AQ86V40 505 aa23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 DENND1AQ8TEH3 1009 aa23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC17Q96LX7 622 aa23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLVAPQ9BX97 442 aa23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEU2Q9Y3R4 380 aa23.71■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRIN3BO60391 1043 aa23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADRB2P07550 413 aa23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARP10275 920 aa23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHC3Q92529 594 aa23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 NYAP2Q9P242 653 aa23.7■■□□□ 1.39
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP5HO75947 161 aa23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP6V1C1P21283 382 aa23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 SESN3P58005 492 aa23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDR2Q01850 454 aa23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 TEX9Q8N6V9 391 aa23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM84AQ96KN4 292 aa23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGEB2O15479 319 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC1A5Q15758 541 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF365Q70YC5 407 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLIS1Q8NBF1 620 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH3GL3Q99963 347 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRABDQ9H4I3 376 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIDD1Q9HB75 910 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACTL7BQ9Y614 415 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAV1Q03135 178 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 INPP5DQ92835 1189 aa23.69■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 EDF1O60869 148 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 PADI6Q6TGC4 694 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 C10orf82Q8WW14 230 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT15P19012 456 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 GJC1P36383 396 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPARCL1Q14515 664 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 DOK7Q18PE1 504 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 P3H1Q32P28 736 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.68■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 P4HA2O15460 535 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 AP1G2O75843 785 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 MFAP3P55082 362 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD27Q96NW4 1050 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A1W2PPM1 405 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 JAG1P78504 1218 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 MXRA7P84157 204 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 HELQQ8TDG4 1101 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMIM24O75264 130 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCTN3O75935 186 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 CA4P22748 312 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALDH3A1P30838 453 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 116
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC9Q8WXX5 260 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.67■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIAS1O75925 651 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEJP0CG39 1038 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM154Q6P9G4 183 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 OTOAQ7RTW8 1153 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 UCMAQ8WVF2 138 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 MIPEPQ99797 713 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPHS2Q9NP85 383 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 FDX1P10109 184 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT5P13647 590 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAN1A1P33908 653 aa23.66■■□□□ 1.38
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms