RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 SLC39A2Q9NP94 309 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 EXOC1Q9NV70 894 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 VWA8A3KMH1 1905 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 KLRC2P26717 231 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 ARMCX5Q6P1M9 558 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 PPFIBP1Q86W92 1011 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 CEP57Q86XR8 500 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 CBWD1Q9BRT8 395 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 FAM213AQ9BRX8 229 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 ASB7Q9H672 318 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 RXFP1Q9HBX9 757 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CXCL2-201ENST00000296031 GRXCR2A6NFK2 248 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 TRAPPC3O43617 180 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 LDHAP00338 332 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PRR29P0C7W0 189 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 IL9P15248 144 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 CYP3A5P20815 502 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PSMD2Q13200 908 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 KMT5BQ4FZB7 885 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 RTP2Q5QGT7 225 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 JADE1Q6IE81 842 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 NELFCDQ8IXH7 590 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 TTPALQ9BTX7 342 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PCIF1Q9H4Z3 704 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 UBE4BO95155 1302 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 TEX28O15482 410 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 XPOTO43592 962 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 RPN1P04843 607 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 EPCAMP16422 314 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 BRCC3P46736 316 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD54Q6NXT1 300 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 KANK3Q6NY19 840 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 SLC22A17Q8WUG5 538 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC34Q96HJ3 373 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 FAM50BQ9Y247 325 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 DERAQ9Y315 318 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PLXNA3P51805 1871 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 GOLGA8IPA6NC78 632 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 GOLGA8JA6NMD2 632 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 I3L4J1 428 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 MBTPS2O43462 519 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 ADH1AP07327 375 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 NFICP08651 508 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 LRPAP1P30533 357 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 GUCY2FP51841 1108 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 STK4Q13043 487 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM132DQ14C87 1099 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 BMT2Q1RMZ1 405 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 SMRP1Q8NCR6 262 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 APOL5Q9BWW9 433 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 NUB1Q9Y5A7 615 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 TGFB1I1O43294 461 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 EXTL3O43909 919 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 RPL17P18621 184 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 FGFR3P22607 806 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 CLCN4P51793 760 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 CREMQ03060 361 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 DPYDQ12882 1025 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA1Q5VX52 437 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 GLYCTKQ8IVS8 523 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 ENGASEQ8NFI3 743 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 BEST2Q8NFU1 509 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PIK3R5Q8WYR1 880 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 FNIP2Q9P278 1114 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 C2CD2Q9Y426 696 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 DLL1O00548 723 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 IL18RAPO95256 599 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PSMD5Q16401 504 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 PDXDC1Q6P996 788 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 SYCE2Q6PIF2 218 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 GPD1LQ8N335 351 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 C5orf42Q9H799 3197 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 TKTP29401 623 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 MCM4P33991 863 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 HS2ST1Q7LGA3 356 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 BRSK2Q8IWQ3 736 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0895Q8NCT3 520 aa27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms