RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 PORP16435 677 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 RGS2P41220 211 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 TMEM53Q6P2H8 277 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SIKE1Q9BRV8 207 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CUEDC2Q9H467 287 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HACL1Q9UJ83 578 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 KCNMA1Q12791 1236 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HGSNATQ68CP4 663 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 BAP1Q92560 729 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 UIMC1Q96RL1 719 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SLC29A2Q14542 456 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 PDXDC1Q6P996 788 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HAS1Q92839 578 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.27■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CAPN9O14815 690 aa23.27■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 T-ENOLP0DO92 83 aa23.27■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.315e-6■□□□□ 9.5
PITX1-201ENST00000265340 GRB10Q13322 594 aa23.27■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 MEIS2O14770 477 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ALDH2P05091 517 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 BMP3P12645 472 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PTPN4P29074 926 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SERPINB8P50452 374 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PNMA5Q96PV4 448 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 KRT82Q9NSB4 513 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 BTBD7Q9P203 1132 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 BICDL2A1A5D9 508 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 MAP7D1Q3KQU3 841 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CCDC174Q6PII3 467 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 KBTBD2Q8IY47 623 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 MGARPQ8TDB4 240 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TRIM9Q9C026 710 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TMEM120BA0PK00 339 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 RASGRF2O14827 1237 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 P4HA2O15460 535 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CHKBQ9Y259 395 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GLTPD2A6NH11 291 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 MAPK13O15264 365 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TBX10O75333 385 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PSMG1O95456 288 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DEPTORQ8TB45 409 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CROTQ9UKG9 612 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DCTN3O75935 186 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 RHOBTB3O94955 611 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CCNE1P24864 410 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 EMP3P54852 163 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CYP4X1Q8N118 509 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 MAGEB18Q96M61 343 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 FAIMQ9NVQ4 179 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GGA3Q9NZ52 723 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 KRT36O76013 467 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 ITGA4P13612 1032 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 PDE1BQ01064 536 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DUPD1Q68J44 220 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 VSTM1Q6UX27 236 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX1-201ENST00000265340 AMNQ9BXJ7 453 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms