RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 SPP2Q13103 211 aa15.88■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.88■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.88■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.88■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 RALAP11233 206 aa15.88■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 LDHDQ86WU2 507 aa15.88■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 COL20A1Q9P218 1284 aa15.87■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 RASA4O43374 803 aa15.87■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 IL9RQ01113 521 aa15.87■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 ASMTLO95671 621 aa15.86■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 FBF1Q8TES7 1133 aa15.86■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 WFS1O76024 890 aa15.85■□□□□ 0.13
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SYP-201ENST00000263233 TMC2Q8TDI7 906 aa15.85■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 AKT1S1Q96B36 256 aa15.85■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 MFSD14AQ96MC6 490 aa15.85■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.85■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.85■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 MAGEB2O15479 319 aa15.85■□□□□ 0.13
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