RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261206.7

ACSS3-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS3, Length 2,666 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3-201ENST00000261206 ATP9AO75110 1047 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 CA4P22748 312 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SNAP25P60880 206 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 LMNB2Q03252 620 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 ATL2Q8NHH9 583 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 MYH11P35749 1972 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CHMP2AO43633 222 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 KRT15P19012 456 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 MAGEA4P43358 317 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CETN1Q12798 172 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SLC1A5Q15758 541 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CD209Q9NNX6 404 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 STK24Q9Y6E0 443 aa20.14■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 A0A1B0GVG6 124 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 TISP43B9A030 160 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 KRT36O76013 467 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SKIP12755 728 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 LAMB3Q13751 1172 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 RASA3Q14644 834 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SMC6Q96SB8 1091 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SMAPO00193 183 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SLITRK3O94933 977 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 RXRBP28702 533 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 ZNF365Q70YC5 407 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 FGD4Q96M96 766 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.13■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CAPN9O14815 690 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 IRF6O14896 467 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SLURP2P0DP57 97 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 KCNA3P22001 575 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 NR1H3Q13133 447 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 USH1GQ495M9 461 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 EPC2Q52LR7 807 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 RELL1Q8IUW5 271 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 DYDC2Q96IM9 177 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CYLDQ9NQC7 956 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 C2CD2LO14523 706 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 RNF8O76064 485 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 OCRLQ01968 901 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 UBE4BO95155 1302 aa20.12■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SREBF1P36956 1147 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 VAMP7P51809 220 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC89Q8N998 374 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SAR1AQ9NR31 198 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 GAKO14976 1311 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 TBX10O75333 385 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 ABHD2P08910 425 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 MAPK4P31152 587 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SHMT1P34896 483 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CACNA2D1P54289 1103 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 HHATQ5VTY9 493 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC22O60826 627 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms