RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 CD302Q8IX05 232 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF558Q96NG5 402 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 ASB7Q9H672 318 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 CARNS1A5YM72 827 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 LACTBL1A8MY62 500 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 DDHD2O94830 711 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00271P0C7V0 271 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 BMPR1AP36894 532 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 DLG4P78352 724 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 CLDN10P78369 228 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 MAN2A1Q16706 1144 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 EPC2Q52LR7 807 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 USP37Q86T82 979 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 SLC35C1Q96A29 364 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 ADCY5O95622 1261 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 KCNE1P15382 129 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PBX3P40426 434 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 BCAR1P56945 870 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TUSC3Q13454 348 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 SARM1Q6SZW1 724 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 KIF12Q96FN5 646 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 FAM161BQ96MY7 647 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 FNBP1Q96RU3 617 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 CGRRF1Q99675 332 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PLVAPQ9BX97 442 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 RB1P06400 928 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM49P0CI25 452 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM49CP0CI26 452 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 OR1G1P47890 313 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 DSC1Q08554 894 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 WDR49Q8IV35 697 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRJQ12913 1337 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 B4GALT3O60512 393 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 ALDH2P05091 517 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PPM1AP35813 382 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 SLC11A1P49279 550 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 FANCCQ00597 558 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 MIIPQ5JXC2 388 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 JADE1Q6IE81 842 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 DERAQ9Y315 318 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 C2CD2Q9Y426 696 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 GALTP07902 379 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TNNI1P19237 187 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PPP3CAQ08209 521 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 KCNH2Q12809 1159 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 VWA3BQ502W6 1294 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF516Q92618 1163 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM5Q9C035 493 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 VPS16Q9H269 839 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 INTS13Q9NVM9 706 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 SPG21Q9NZD8 308 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 NRP1O14786 923 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 STX10O60499 249 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINC1P01008 464 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 NFICP08651 508 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXD11-201ENST00000249504 GTF2H1P32780 548 aa21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms