RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 PRKCEQ02156 737 aa22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CCT6BQ92526 530 aa22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 WNK4Q96J92 1243 aa22.13■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 RASSF9O75901 435 aa22.12■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 IVDP26440 423 aa22.12■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.12■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 RGS20O76081 388 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 POTEJP0CG39 1038 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ATP5DP30049 168 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 PIK3CAP42336 1068 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 OAZ1P54368 228 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ACTR2P61160 394 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 STRN3Q13033 797 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ITIH4Q14624 930 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CNGA2Q16280 664 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 XKR3Q5GH77 459 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 MON1BQ7L1V2 547 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ATF2P15336 505 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 BACE1P56817 501 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 PSTPIP1O43586 416 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 STAM2O75886 525 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ACSL3O95573 720 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 TTC4O95801 387 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 MNAT1P51948 309 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ITGA8P53708 1063 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 REPS2Q8NFH8 660 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 FAM84AQ96KN4 292 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 KLC4Q9NSK0 619 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CHKAP35790 457 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SCTRP47872 440 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SP4Q02446 784 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 LONRF1Q17RB8 773 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SCLT1Q96NL6 688 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ADCY8P40145 1251 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CCNG2Q16589 344 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 MTERF2Q49AM1 385 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 BBOF1Q8ND07 529 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 KCNN1Q92952 543 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ARID2Q68CP9 1835 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SORBS3O60504 671 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CUL2Q13617 745 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 GNPTABQ3T906 1256 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 CCDC38Q502W7 563 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 JDP2Q8WYK2 163 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 WDR81Q562E7 1941 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 RALAP11233 206 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 ACOT2P49753 483 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 EMC2Q15006 297 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms