RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hook3Q8BUK6 718 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr60Q8C761 999 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl11Q8CE33 709 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajc3Q91YW3 504 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep72Q9D3R3 646 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Iqcf1Q9D9K8 182 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf6Q9DBU5 667 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnh7Q9ER47 1195 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myoz2Q9JJW5 264 aa7.02□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc7bE9Q6P5 843 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UgcgO88693 394 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccnd2P30280 289 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UrosP51163 265 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf2bP62915 316 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 E2f8Q58FA4 860 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AlcamQ61490 583 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr156Q6PCP7 798 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Naif1Q6PFD7 327 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Raver2Q7TPD6 673 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc17a8Q8BFU8 601 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sun2Q8BJS4 731 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppm1kQ8BXN7 372 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dus1lQ8C2P3 475 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc8cQ8R502 803 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nt5c1bQ91YE9 573 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tgm5Q9D7I9 724 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex9Q9D845 387 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col2a1P28481 1487 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DgkhD3YXJ0 1156 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5795E9PZN8 263 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc27a2O35488 620 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 E2f6O54917 272 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc27a3O88561 667 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tom1O88746 492 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SpoplQ2M2N2 392 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dzip1lQ499E4 774 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddhd1Q80YA3 547 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp4Q8BFV3 398 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf879Q8BI99 563 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TbckQ8BM85 762 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AdigQ8R400 80 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Caskin2Q8VHK1 1201 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med15Q924H2 789 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rsc1a1Q9ER99 582 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 JmyQ9QXM1 983 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clec4aQ9QZ15 238 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nphs1Q9QZS7 1256 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scnn1bQ9WU38 638 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Extl3Q9WVL6 918 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2ab1S4R196 498 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata31d1aE9QA35 1336 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 JrklB2RRL2 523 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr247E9PVJ7 320 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6583E9Q8Z1 469 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr819K7N727 320 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sema6bO54951 886 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LdhbP16125 334 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tph1P17532 447 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Irf8P23611 424 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rmdn3Q3UJU9 470 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nt5c2Q3V1L4 560 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tigd5Q499M4 642 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Creb3l2Q8BH52 521 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmco6Q8BQX5 494 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc169Q8BXX9 214 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cabs1Q8C633 391 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxp3Q99JB6 429 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fundc1Q9DB70 155 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adrm1Q9JKV1 407 aa7.01□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttll6A4Q9E8 822 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r15L7N2A0 855 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wnt7bP28047 349 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnn2P58390 839 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rit2P70425 217 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Drp2Q05AA6 957 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankmy2Q3TPE9 440 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rufy4Q3TYX8 563 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nat8lQ3UGX3 299 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam92bQ3V2J0 292 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Msl1Q6PDM1 616 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PimregQ8BFY7 231 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trmt13Q8BYH3 481 aa7□□□□□ -1.29
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uba6Q8C7R4 1053 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.1 ms