RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mrm1	Q99J25	320 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mov10l1	Q99MV5	1187 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pramel1	Q99MW3	458 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pard3b	Q9CSB4	1203 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chmp5	Q9D7S9	219 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnfrsf22	Q9ER62	198 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dpp7	Q9ET22	506 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stk4	Q9JI11	487 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cacng4	Q9JJV4	327 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Serinc1	Q9QZI8	453 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf103	Q9R1W3	683 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp10d	Q8K2X1	1416 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nsd2	Q8BVE8	1365 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adh6b	A0A1D5RMB0	384 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ifit1bl1	D3Z6F0	470 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ermard	E9Q048	622 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm20517	G3UVU6	152 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Serpinb9	O08797	374 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rgs2	O08849	211 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rdx	P26043	583 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mcm4	P49717	862 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ctsw	P56203	371 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Morf4l1	P60762	362 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adm	P97297	184 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jup	Q02257	745 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gch1	Q05915	241 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gdf9	Q07105	441 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prickle1	Q3U5C7	832 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eml4	Q3UMY5	988 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bbs1	Q3V3N7	593 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clul1	Q3ZRW6	464 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pdp2	Q504M2	532 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Akap4	Q60662	849 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pml	Q60953	885 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sspn	Q62147	216 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mapk3	Q63844	380 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbccd1	Q640P7	552 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	St8sia4	Q64692	359 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddx51	Q6P9R1	639 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc154	Q6RUT8	657 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pgrmc2	Q80UU9	217 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atl1	Q8BH66	558 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Depdc1b	Q8BH88	529 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Anks1b	Q8BIZ1	1259 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stx16	Q8BVI5	326 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Calhm6	Q8C9E8	313 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmie	Q8K467	153 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tgds	Q8VDR7	355 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp2r5d	Q91V89	594 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdha10	Q91Y20	946 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ugp2	Q91ZJ5	508 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Srfbp1	Q9CZ91	441 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Oxsm	Q9D404	459 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tspan17	Q9D7W4	270 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Syt10	Q9R0N4	523 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Morf4l2	Q9R0Q4	288 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttc21b	Q0HA38	1315 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rad21l1	A2AU37	552 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr95	D3Z7A8	784 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10608	E9PZ13	166 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp605	E9QAH2	694 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3642	K7N6V4	267 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hdac3	O88895	424 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cd93	O89103	644 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnmt3c	P0DOY1	709 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prkce	P16054	737 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccnb1	P24860	430 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pik3r1	P26450	724 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adssl1	P28650	457 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cd9	P40240	226 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stat5b	P42232	786 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adss	P46664	456 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sgcd	P82347	289 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dab1	P97318	588 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prelid2	Q0VBB0	177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gsdma2	Q32M21	443 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q3KNL4	93 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam35a	Q3UEN2	891 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bbof1	Q3V079	533 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ehmt1	Q5DW34	1296 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zdhhc8	Q5Y5T5	762 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vav2	Q60992	868 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bad	Q61337	204 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tfe3	Q64092	572 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Utp14a	Q640M1	767 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pkp4	Q68FH0	1190 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q6GQU0	248 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cpa4	Q6P8K8	420 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bcr	Q6PAJ1	1270 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tlr13	Q6R5N8	991 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dsg4	Q7TMD7	1041 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyld	Q80TQ2	952 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adam29	Q811Q4	763 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Insig1	Q8BGI3	259 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Thnsl1	Q8BH55	747 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Man2a2	Q8BRK9	1152 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttc22	Q8C159	568 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sept11	Q8C1B7	431 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pex5l	Q8C437	567 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Parp9	Q8CAS9	866 aa		4.38	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.9 ms