RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A STT4P37297 1900 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A DPM1P14020 267 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A JEM1P40358 645 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A LOH1P47055 219 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ILM1P47155 203 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A COS1P53822 381 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SNZ1Q03148 297 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A CDC7P06243 507 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YPR170W-BP0C5R9 85 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YKR104WP0CE69 306 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SAR1P20606 190 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A VAM7P32912 316 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A COS8P38723 381 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YHR125WP38831 101 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A COG3P40094 801 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ICE2P40499 491 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A VPS60Q03390 229 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YRA1Q12159 226 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A DCC1P25559 380 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YDL180WQ12301 547 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A KRE5P22023 1365 aa-0.38□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A CAR2P07991 424 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SOP4P39543 234 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A CAB4P53332 305 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A DBP6P53734 629 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ALG11P53954 548 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A BER1Q06688 274 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RRP40Q08285 240 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SWI1P09547 1314 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SUA5P32579 426 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YKE4P40544 346 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SBH2P52871 88 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A AIF1P52923 378 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A GAS3Q03655 524 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YDR124WQ04608 324 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YLR446WQ06204 433 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A BTS1Q12051 335 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SIA1Q12212 622 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ROM2P51862 1356 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A CAJ1P39101 391 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A AST2P39945 430 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A STE23Q06010 1027 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-0.39□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL43BP0CX26 92 aa-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ERG24P32462 438 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A FZF1P32805 299 aa-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A EDC3P39998 551 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A MIM1Q08176 113 aa-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YOR029WQ12243 111 aa-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A STH1P32597 1359 aa-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ATG15P25641 520 aa-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A DAD2P36162 133 aa-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A EMC2P47133 292 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ATG17Q06410 417 aa-0.4□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A DSF1P0CX08 502 aa-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YNR073CP0CX09 502 aa-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A TRX1P22217 103 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A UBA1P22515 1024 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A OAC1P32332 324 aa-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YNL217WP40152 326 aa-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YMR144WP40214 342 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YNR068CP53754 272 aa-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A TAZ1Q06510 381 aa-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YPL119C-AQ3E751 87 aa-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A PPH21P23594 369 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A ATG22P25568 528 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A KDX1P36005 433 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A YKL070WP36087 169 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A VOA1P53262 265 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A TAF11Q04226 346 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A APC9Q12107 265 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A NFI1Q12216 726 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A HTL1Q9URQ5 78 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A HIS1P00498 297 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A SCL1P21243 252 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A LAS1P36146 502 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A PET100P38958 111 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A TIF34P40217 347 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A YJR079WP47126 109 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A TOM22P49334 152 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A SEC10Q06245 871 aa-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A POX1P13711 748 aa-0.42□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A SWC5P38326 303 aa-0.42□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A YNL143CP53908 130 aa-0.42□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A UAF30Q08747 228 aa-0.42□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A TAL1P15019 335 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A PEX3P28795 441 aa-0.42□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A YET1P35723 206 aa-0.42□□□□□ -2.48
YPL060C-AYPL060C-A GPX1P36014 167 aa-0.42□□□□□ -2.48
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