RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	SAM37	P50110	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	NIF3	P53081	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YNR061C	P53747	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	CTF19	Q02732	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ROY1	Q04847	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	BLS1	Q06071	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ENB1	Q08299	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PRR2	Q12310	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	EMC3	P36039	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	LDH1	P38139	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	FIG1	P38224	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TRS20	P38334	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MTC3	P53077	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	DYN2	Q02647	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	EST3	Q03096	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RCE1	Q03530	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	POS5	Q06892	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	GAS5	Q08193	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PCL9	Q12477	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MIH1	P23748	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ATS1	P31386	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YBR071W	P38243	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ICS2	P38284	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PET130	P47065	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MGA1	P53050	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	BUD25	P85052	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	LDS2	Q08218	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	COX3	P00420	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ANB1	P19211	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PRO1	P32264	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	DAD2	P36162	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TAE1	P38340	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	COX15	P40086	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	COX5A	P00424	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	HIP1	P06775	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SLC1	P33333	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YGR079W	P53249	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TOA2	P32774	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	DRE2	P36152	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YHL044W	P38727	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YHL041W	P38730	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TIS11	P47977	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MSY1	P48527	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TGL2	P54857	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	HUT1	Q12520	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YGL262W	P53054	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	COQ11	Q05892	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	IES4	Q08561	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PAI3	P01094	68 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.64	not detected
RGT1	YKL038W	AGP2	P38090	596 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	WSS1	P38838	269 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	TMA23	Q03525	211 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YML018C	Q03730	393 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PUT1	P09368	476 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	INO4	P13902	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SKN7	P38889	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SMK1	P41808	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SPG5	P42933	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YJR124C	P47159	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	YGR035C	P53222	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PGA1	P53896	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	BNA5	Q05979	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	AAD4	Q07747	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	SUL2	Q12325	893 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MAK32	P23060	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	PAU3	P25610	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MTC7	P32633	139 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	FMT1	P32785	401 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	EAF5	P39995	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	GAT1	P43574	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	MUP1	P50276	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	HHT1	P61830	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGT1	YKL038W	ARA2	Q04212	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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