RNA–Protein interactions for RNA: YGR296W

YRF1-3, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-3, Length 5,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3YGR296W TMS1Q12116 473 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W RFA1P22336 621 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W FMP46P36141 133 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SMA2Q04658 369 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YMR254CQ04838 102 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YDR286CQ05530 114 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YIL067CP40514 678 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W GAS2Q06135 555 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W ARO3P14843 370 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W ECM15P35195 104 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W AIM11P87275 137 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W PFA5Q03289 374 aa7.19□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YCR102CP25608 368 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W MCH2P36032 473 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YDR344CQ05510 147 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W PCC1Q3E833 88 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W PHO5P00635 467 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W THI2P38141 450 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W PRE3P38624 215 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W CFD1P40558 293 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YJR056CP47115 236 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W FPR1P20081 114 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W MSS4P38994 779 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W LCL3P53153 274 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YGR126WP53274 230 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W RNH203Q12338 110 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W DPM1P14020 267 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W PAM16P42949 149 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W ARO8P53090 500 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W TPC1P53257 314 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W RNH201P53942 307 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W MDM30Q05930 598 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SWT1Q12104 458 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W FIG2P25653 1609 aa7.18□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SCEIP03882 235 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SEC59P20048 519 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W PFS1P38872 237 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SUN4P53616 420 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W ARL3Q02804 198 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W GTO3Q04806 366 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W NAT3Q06504 195 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W TGS1Q12052 315 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W AAC1P04710 309 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SPO13P23624 291 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YBR096WP38256 230 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W DCN1Q12395 269 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YOR186WQ08560 144 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YOR015WQ12169 119 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data7.17□□□□□ -1.26not detected
YRF1-3YGR296W TNA1P53322 534 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YOR376WQ08900 122 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W ENV7Q12003 364 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W BAR1P12630 587 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YCP4P25349 247 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W TCM62P38228 572 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W OST1P41543 476 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W NSE4P43124 402 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W GON7P46984 123 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YGL114WP53134 725 aa7.17□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W CLG1P35190 452 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YDR387CQ04162 555 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W RPB11P38902 120 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W DAP1Q12091 152 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YLR108CQ12259 485 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W DAT1P13483 248 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W PHO85P17157 305 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W MCP1Q12106 302 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YDL211CQ12121 372 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SPT14P32363 452 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W PPG1P32838 368 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W WSS1P38838 269 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YOS1Q3E834 85 aa7.16□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W HSP12P22943 109 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SED4P25365 1065 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W REC114P32841 428 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W MPM1P40364 252 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W ECO1P43605 281 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W BNA2P47125 453 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W DYN2Q02647 92 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W MES1P00958 751 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W CPR4P25334 318 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W TIM17P39515 158 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W HAP3P13434 144 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W MNS1P32906 549 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YKL097CP34245 136 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SSS1P35179 80 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YNL092WP53934 400 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W SUR7P54003 302 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa7.15□□□□□ -1.26
YRF1-3YGR296W RPL30P14120 105 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
YRF1-3YGR296W SPC29P33419 253 aa7.15□□□□□ -1.27
YRF1-3YGR296W FIG1P38224 298 aa7.15□□□□□ -1.27
YRF1-3YGR296W TTI2P47168 421 aa7.15□□□□□ -1.27
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