RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CBFA2T3	O75081	653 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ASMTL	O95671	621 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MYL2	P10916	166 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT4	P19013	534 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	NEK2	P51955	445 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RASA2	Q15283	850 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ITIH2	P19823	946 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CHN2	P52757	468 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	C21orf59	P57076	290 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	LIN9	Q5TKA1	542 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TBCK	Q8TEA7	893 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895		A8MXQ7	604 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT38	O76015	456 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	NUDT17	P0C025	328 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ANPEP	P15144	967 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	NUP107	P57740	925 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ART3	Q13508	389 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	NTRK3	Q16288	839 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	NDUFB5	O43674	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	FKBP6	O75344	327 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DDAH1	O94760	285 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CYP11B2	P19099	503 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PML	P29590	882 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TLCD1	Q96CP7	247 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	GREM2	Q9H772	168 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	POTEM	A6NI47	508 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CREB1	P16220	341 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	OCRL	Q01968	901 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB20	Q9NX57	234 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	S100A1	P23297	94 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MCAM	P43121	646 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	LPIN1	Q14693	890 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	COQ7	Q99807	217 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PHF24	Q9UPV7	400 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TBX10	O75333	385 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TTC4	O95801	387 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	FECH	P22830	423 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MAGEA4	P43358	317 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49

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