RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637823.1

CLN6-223, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, human

TSL 5

Gene CLN6, Length 717 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN6-223	ENST00000637823	WDR59	Q6PJI9	974 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	SPAG5	Q96R06	1193 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	PADI3	Q9ULW8	664 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	DERA	Q9Y315	318 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CLN6-223	ENST00000637823	VNN1	O95497	513 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	PIK3CA	P42336	1068 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	GJA8	P48165	433 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	MFAP3	P55082	362 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	JAM2	P57087	298 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	PAK2	Q13177	524 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	LPIN1	Q14693	890 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	NT5C1B	Q96P26	610 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SNTG2	Q9NY99	539 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	C2CD2	Q9Y426	696 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SERPING1	P05155	500 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	GHR	P10912	638 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SELP	P16109	830 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	CD52	P31358	61 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	STAT1	P42224	750 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	NCOA4	Q13772	614 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	DSC3	Q14574	896 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	ASIC2	Q16515	512 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	JADE1	Q6IE81	842 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	GJB7	Q6PEY0	223 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	HACE1	Q8IYU2	909 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TATDN2	Q93075	761 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SNX27	Q96L92	541 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TOX2	Q96NM4	488 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	CHP1	Q99653	195 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	KCND1	Q9NSA2	647 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	IPP	Q9Y573	584 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	LRRN2	O75325	713 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	CCDC172	P0C7W6	258 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	COL6A1	P12109	1028 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SKI	P12755	728 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	FER	P16591	822 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SOX5	P35711	763 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	RAB27A	P51159	221 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	GCNT1	Q02742	428 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TRPC3	Q13507	836 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	XKR4	Q5GH76	650 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	TAF4B	Q92750	862 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	FAM84A	Q96KN4	292 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	CNTN3	Q9P232	1028 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CLN6-223	ENST00000637823	PARP2	Q9UGN5	583 aa		12.68	□□□□□ -0.38

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