RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	C16orf87	Q6PH81	154 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SLF2	Q8IX21	1173 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	TTLL6	Q8N841	843 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624		K7ENM7	598 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ATP6V1G1	O75348	118 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SLC16A2	P36021	539 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	LMNB2	Q03252	620 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ZBTB17	Q13105	803 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	HIC1	Q14526	733 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	CNGA3	Q16281	694 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	IRF6	O14896	467 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ATP2B4	P23634	1241 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	GPS1	Q13098	491 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ARL10	Q8N8L6	244 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	FAM13C	Q8NE31	585 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SPON1	Q9HCB6	807 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	TTC36	A6NLP5	189 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	LPXN	O60711	386 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	DPEP1	P16444	411 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	MMP13	P45452	471 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	MXD3	Q9BW11	206 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	COPE	O14579	308 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ITIH2	P19823	946 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	FECH	P22830	423 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	BTD	P43251	543 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	GCLM	P48507	274 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ATP2A3	Q93084	1043 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	NDC80	O14777	642 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	AADACL2	Q6P093	401 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	CPXCR1	Q8N123	301 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	GH1	P01241	217 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	CAV1	Q03135	178 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	P3H1	Q32P28	736 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	ILDR2	Q71H61	639 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	DGKH	Q86XP1	1220 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	PDIK1L	Q8N165	341 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	UCMA	Q8WVF2	138 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624		E7ENQ6	273 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	STAT3	P40763	770 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	MECOM	Q03112	1051 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	BNIP1	Q12981	228 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624		Q4G0T1	1027 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	PIDD1	Q9HB75	910 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SBF2	Q86WG5	1849 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	KRT4	P19013	534 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	MAGEA4	P43358	317 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	MXI1	P50539	228 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	IYD	Q6PHW0	289 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SLC51A	Q86UW1	340 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	BAP1	Q92560	729 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	BTBD6	Q96KE9	485 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	MYH10	P35580	1976 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	SCFD2	Q8WU76	684 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PXN-222	ENST00000637624	PIM2	Q9P1W9	311 aa		12.85	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms