RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636868.1

ATRX-222, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-222	ENST00000636868	HAPLN3	Q96S86	360 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	USP18	Q9UMW8	372 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868		H7C1D1	291 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	PJA2	O43164	708 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	PRAMEF4	O60810	478 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	FLT3LG	P49771	235 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	ERV3-1	Q14264	604 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	FAM153C	Q494X1	144 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	FBXL22	Q6P050	247 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	VPS37D	Q86XT2	251 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-222	ENST00000636868	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ADM5	C9JUS6	153 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868		M0R2C6	588 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ALPL	P05186	524 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	GCSH	P23434	173 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ZNF174	Q15697	407 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	NRAC	Q8N912	160 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ICK	Q9UPZ9	632 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SOCS2	O14508	198 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	FGR	P09769	529 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SLC9A1	P19634	815 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	VAMP1	P23763	118 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SEMA3A	Q14563	771 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	CHST14	Q8NCH0	376 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	GAB3	Q8WWW8	586 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	NRP2	O60462	931 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PRSS23	O95084	383 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SCP2	P22307	547 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	HTR6	P50406	440 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	NRG3	P56975	720 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TXNRD1	Q16881	649 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PROSER3	Q2NL68	480 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TRMO	Q9BU70	441 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TARM1	B6A8C7	271 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ADCY6	O43306	1168 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	KLF4	O43474	513 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PROM1	O43490	865 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TMEM127	O75204	238 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	CHRM2	P08172	466 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	PFKM	P08237	780 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SRGN	P10124	158 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	ARHGAP25	P42331	645 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	KRT71	Q3SY84	523 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	DRC7	Q8IY82	874 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TUBB4A	P04350	444 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	FAM153B	P0C7A2	387 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	SLC6A2	P23975	617 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	HILS1	P60008	231 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	RHD	Q02161	417 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATRX-222	ENST00000636868	CNGA4	Q8IV77	575 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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